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Profilo dell’espressione dei geni nei primi stadi della differenziazione indotta dall’acido retinoico delle cellule di neuroblastoma SH-SY5Y. di Truckenmiller ME, Vawter MP, Cheadle C, Coggiano M, Donovan DM, Freed WJ, Becker KG.
 
 
Data: 23/05/2003
Tipologia: MDB - Documentazione
Lingua: Inglese
Pubblicazione: Restor Neurol Neurosci
Anno: 2001
Fonte: Restor Neurol Neurosci 18(2-3):67-80.
 
 
Descrizione:

SCOPO. La linea umana di cellule SH-SY5Y è un modello stabilito di differenziazione neurale indotta dall’acido retinoico (RA). Abbiamo impiegato un’ampia microeserie umana di 15K (15.000 geni) e ci siamo concentrati soprattutto sulla Neuroserie (1152 geni) per esaminare i cambiamenti dell'espressione genetica nei primi stadi del processo di differenziazione (6 ore), prima di osservare i cambiamenti della morfologia o della crescita. METODI. 33 sonde di CDNA marcate-P, preparate da estratti di RNA di colture trattate con RA e di controllo, sono state ibridate alle membrane della serie e sono stati misurati e confrontati i livelli d'espressione. RISULTATI. Nella serie 15K, il 19 % dei geni era diminuito (0,4 % sono stati definiti geni ed il resto erano espressed sequence tags (ESTs) o sconosciuti) e il 9 % era aumentato(4,2 % definiti geni). Nella Neuroserie, il 3 % è diminuito e l’8 % è aumentato. CONCLUSIONI. Presentiamo un sommario dei profili dei geni, che include i fattori di trascrizione, i geni associati al ciclo delle cellule, la forma delle cellule, la neurotrasmissione, i filamenti intermedi ed altri. La prevalenza di pochi geni diminuiti nell’ampia serie 15K e l’aumento dei geni nella serie neuro suggerisce una variazione del modello d’espressione del gene associata alla differenziazione. La predominanza di ESTs fra i geni diminuiti indica che un grande numero di geni ancora non identificati è represso nella fase iniziale della differenziazione neurale.

 
 
 

SCOPO. La linea umana di cellule SH-SY5Y è un modello stabilito di differenziazione neurale indotta dall’acido retinoico (RA). Abbiamo impiegato un’ampia microeserie umana di 15K (15.000 geni) e ci siamo concentrati soprattutto sulla Neuroserie (1152 geni) per esaminare i cambiamenti dell'espressione genetica nei primi stadi del processo di differenziazione (6 ore), prima di osservare i cambiamenti della morfologia o della crescita. METODI. 33 sonde di CDNA marcate-P, preparate da estratti di RNA di colture trattate con RA e di controllo, sono state ibridate alle membrane della serie e sono stati misurati e confrontati i livelli d'espressione. RISULTATI. Nella serie 15K, il 19 % dei geni era diminuito (0,4 % sono stati definiti geni ed il resto erano espressed sequence tags (ESTs) o sconosciuti) e il 9 % era aumentato(4,2 % definiti geni). Nella Neuroserie, il 3 % è diminuito e l’8 % è aumentato. CONCLUSIONI. Presentiamo un sommario dei profili dei geni, che include i fattori di trascrizione, i geni associati al ciclo delle cellule, la forma delle cellule, la neurotrasmissione, i filamenti intermedi ed altri. La prevalenza di pochi geni diminuiti nell’ampia serie 15K e l’aumento dei geni nella serie neuro suggerisce una variazione del modello d’espressione del gene associata alla differenziazione. La predominanza di ESTs fra i geni diminuiti indica che un grande numero di geni ancora non identificati è represso nella fase iniziale della differenziazione neurale.

 
 
 

 

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